CONGRES NATIONAL DE LA SFM 2017
 

Programme Préliminaire



Système CRISPR-CAS9
Conférence plénière
 CRISPR-Cas : du système immunitaire bactérien à l’outil révolutionnaire d’ingénierie des génomes (Philippe Horvat)
Utilisation de l’outil génétique CRISPR-Cas9 pour mieux comprendre et combattre les maladies fongiques chez l'homme (Fabrice Jossinet)
Diversité, dynamique et évolution des systèmes CRISPR-Cas9 (Marie Touchon)

Capture de séquences par hybridation
Exploration ciblée d’échantillons métagénomiques (Cyrielle Gasc)
Caractérisation des pathogènes par capture de gènes (Naddia Haddad)
Métatranscriptomique ciblée pour la métagénomique fonctionnelle (Roland Marmeiesse)

Intérêt de la cytométrie en flux en microbiologie (en Partenariat avec l’Association Française de Cytométrie)

Evolution in Microbial Analytics: Flow Cytometry, a Multi-Parametric Global Approach (Pierre Burguière)
Intérêt de la cytométrie en flux pour la caractérisation de l'état physiologique des microorganismes (Marielle Bouix)
Applications de la Cytométrie en flux à l’industrie des vaccins (Jean Reyes)

Des mycobactéries et des hommes
A l’origine du complexe M. tuberculosis : une histoire de rugosité (Roland Brosch)
M. tuberculosis complex : un compagnon fidèle de l’homme (Sebastien Gagneux) 
Complexe M. abscessus : une autre histoire de rugosité (Jean-Louis Herrmann)

Résistance en milieu tropical 
Actualités du traitement antibiotique de l'ulcère de Buruli (Jérôme Robert) 
Aggravation paradoxale dans le traitement de l'ulcère de Buruli (Laurent Marsollier)
Antibiorésistance dans la lèpre (Emmanuelle Cambau)

QUAMIC 2017 : focus sur les hémocultures  
Les phases critiques du processus hémoculture (Brigitte Lamy)
Antibiogramme direct à partir des hémocultures (Christian Cattoen)
Identification rapide à partir des hémocultures (Agnes Ferroni)

QUAMIC 2017 : Focus sur la microbiologie délocalisée
Réponses possibles par la biologie délocalisées (Patrice Laudat)
Place et limites des TDR et TROD (J-L Galinier)
Gestion des hémocultures : délocalisées ou pas (Christian Cattoen)

Les Burkholderia

Classification et diversité des Burkholderia (Christine Segonds) 
infections associées aux Burkholderia (Hélène Guet Revillet)
Résistances naturelles et acquises (Patrick Pleisiat)

Forensic and Post mortem microbiology in the 21 st century (En Partenariat avec l’ESCMID Study Group for Forensic and Postmortem Microbiology)
Forensic pathology and importance of microbiological investigations( Paul Fornes)
The Role of Microbiology in Forensic Science and Post-mortem examinations: a Special Focus on Molecular Diagnosis (Amparo Fernandez-Rodriguez)
Legal medicine and anthropology; pathogens in conservd organs of kings and mummies (Philippe Charlier)

Mécanismes de colonisation de Clostridium difficile (en partenariat avec BSPIT)
L'hôte, le microbiote et la bactérie : les secrets de la colonisation par Clostridium difficile (Claire Janoir)
Le facteur de la réponse générale au stress Sigma joue un rôle central dans les stratégies d'adaptation de Clostridium difficile lors de la colonisation du tube digestif (Isabelle Martin-Verstraete)

CA-SFM EUCAST : Phénotype de résistance possible ou impossible
Bactéries Gram positifs  (Vincent Cattoir)
Les enterobactéries (Richard Bonnet)
Les bactéries non fermantantes (Patrick Plésiat)

Endocrinologie microbienne : rôles de l’axe intestin-cerveau sur la santé
La psychomicrobiotique : sortir du cerveau pour mieux soigner les maladies psychiques (Guillaume Fond)
Microbiote intestinal et troubles alimentaires (Sergueï Fetissov)
Probiotiques et troubles neuro-psychiatriques (Vassilia Theodorou)

The lung microbiome and infectious disease
Lung Microbiome (Geneviève Hery-Arnaud)
The pulmonary virome (Laurence Josset) 
The pulmonary mycobiome (Laurence Drlhaes)

Transplantation fécale

Le microbiote intestinal : implication en pathologie humaine (Harry Sokol)
Clostridium difficile et transplantation fécale (Fréderic Barbut)
La transplantation fécale dans l’ICD : une expérience française (Tatiana Galperine)

Experimental evolution and population studies for functional discoveries

Unravelling the genetic specificities of the hyper virulent ST17 lineage of group B streptococci (Philippe Glaser)

Experimental evolution of rhizobia to understand host adaptation (Catherine Masson-Boivin)
Links between Transcription, Environmental Adaptation and Gene Variability in Escherichia coli  (Olivier Tenaillon)

Legionella genomics, epidemiology, typing and pathogenicity
Legionella: New insights gained through genomics and comparative genomics (Carmen Buchrieser)
Functional analyses of secreted virulence factors of Legionella pneumophila (Hubert Hilbi)
Contribution of whole genome sequencing to the investigation of local L. pneumophila outbreaks and global epidemiology studies (Sophie Jarraud)

Génomique épidémiologique des infections bactériennes
La génomique au service de la biologie des populations et de l'épidémiologie: l'exemple de Listeria monocytogenes (Sylvain Brisse)
Phylogénomique de Vibrio cholerae 01 en Afrique durant la 7ème pandémie (Francois-Xavier Weill)

Microbiologie cellulaire
Cell biology of Brucella abortus infection (Suzana Salcedo)
Cell biology of Coxiella burnetti infection (Matteo Bonazzi)
Biologie cellulaire de Shigella et Salmonella (Jost Enninga)

Toxin-antitoxin modules in bacterial virulence and persistence
How TA modules in bacterial virulence ? (Kenn Gerdes)
TA modules in Salmonella persisters in macrophages (Sophie Helaine)
Exploitation of a novel Mycobacterium tuberculosicidal toxin for the development of new medicines against tuberculosis (Olivier Neyrolles)

Host-pathogen interaction: a subversion story (en partenariat avec la SFI)
Invasive meningococcal disease : a disease of the endothelial (Sandrine Bourdoulous)
Hypoxia induction during Shigella infection (Benoît Marteyn) 

Brucella virulence factors, the bad and the good (Jean-Pierre Gorvel)  

Immunité innée anti-bactérienne  

Immunité cytosolique ; expemple de Francisella tularensis (Thomas Henry) 
Toxines de coli et impact sur le système immunitaire (Laurent Boyer)  
Immunité antibactérienne-Leçons issues de l'étude du planaire (Eric Ghigo)

Mécanisme d’entrée et devenir des pathogènes
Salmonella alters host macrophage polarization to promote survival (Sophie Helaine)
Titre à définir (Isabelle Tardieux)
Identification of novel signaling networks that up- or down-regulate L. monocytogenes infection (javier Pizarro-Cerda)

Relations bactéries cancer
Où placer la frontière entre commensalisme et la pathogénicité bactérienne ? (Eric Oswald)
Helicobacter et cancer (Philippe Lehours)
Cibler le microbiote intestinal pour lutter contre le cancer du côlon (Bonnet Richard) 

La guerre du fer 
Bacterial iron acquisition strategies during infections, targets for new antibiotics (Isabelle Schalk)
Host defense mechanism against siderophilic bacteria (Sophie Vaulont) 
Interplay between siderophores and colibactin in emerging pathogenic clones of Enterobacteriacae (Patricia Martin) 

2017, l’année de l'autophagie  (en partenariat avec le le Club Francophone de l'Autophagie)

Pourquoi un prix Nobel de médecine sur l'autophagie ? (Mathias Faure) 
L'exemple d'E. coli (Hang Nguyen) 
L'exemple des herpes virus (Audrey Esclatine)

Inhibition de la virulence bactérienne, une nouvelle stratégie anti-infectieuse
L'inhibition du quorum sensing chez les bactéries (Christian Van Delden)
L'inhibition des sortases des bactéries à Gram positif (Philippe Moreillon)
L'inhibition des systèmes de sécrétion de type III des bactéries à Gram négatif (Eric Faudry) 

Utilisation des antiseptiques et antibio-résistance
Mécanismes d’action et de résistance des antiseptiques (Jean-Yves Maillard)
Exposition aux antiseptiques et antibio-résistance (Sylvie Buffet-Bataillon)
Conséquences cliniques de la résistance aux antiseptiques (Jean-Ralph Zahar)

Micro-organismes et biocontrôle 
Outil de meta-metabolomique pour évaluer l'impact des produits de biocontrôle sur les communautés microbiennes en présence (Cédric Bertrand)
Combinaison des approches antibiose et antivirulence pour lutter contre les phytopathogènes Dickeya et Pectobacteriumènes (Denis Faure)
Lipopeptides d'origine microbienne : agents prometteurs de biocontrôle aux multiples modes d'action (Philippe Jacques)
Norine, Florine, des outils bioinformatiques pour le criblage de nouveaux peptides nonribosomiques (Valérie Leclère)

Régulations transcriptionnelles et post-transcriptionnelles
small RNA (Pascale Romby)
Vers une stratégie anti-virulence issue de l'étude de mécanismes de régulation (Anne Blanc-Potard)
A Eukaryotic-like Serine/Threonine Kinase Protects Staphylococci against Phages (David Bikard)

Bactériophages : interaction avec les bactéries et perspective thérapeutiques
Le transfert de gènes de résistance aux antibiotiques par les phages: où en est-on ? (Marie-Agnès Petit)
Les bactériophages, manipulateurs des populations bactériennes (Laurent Debarbieux)
Impact des prophages dans la pathogénicité, la diversification et l’évolution des Salmonellae (Lionello Bossi)

HPV oncogenes et dépistage du cancer du col de l'utérus a l'ère du DOCCU 
L'avis du gynécologue (Xavier Carcopino)
L'avis du virologue (Philippe Halfon)
L‘aspect santé publique

Encéphalites infectieuses: bilan épidémiologique et des recommandations de prise en charge (en partenariat avec la SPILF) 
Le bilan de la cohorte ENCEIF (Alexandra Mailles) 
Le groupe de recours de la spilf pour la prise en charge des cas d'encéphalites compliqués : bilan et valeur ajoutée pour l'équipe soignante et le patient (Jean-Paul Sthal)
La RPC encéphalite  coordonnée par la Spilf, avec la SFM at autres sociétés savantes: application pour le diagnostic biologique (Patrice Morand  et Jean-Louis Herrrmann) 

Virus: foetal infections and immunity  (en partenariat avec l’ASM)
Immunology of the fetus and newborn, immune defenses acquisition (Sophie Candon) 
Fetal brain development and virus induced damages (Stéphane Chavanas)   
CMV and pregnancy  immunoglobulins and vaccine perspectives (Daniele Lilleri) 

Pregnancy and viral epidemics, diagnosis and prevention  

ZIKA and pregnancy actuality (Cyril Huissoud)
CMV and pregnancy antiviral treatments and recommendations (Marianne Leruez-Ville)
Pregnancy and vaccines (Odile Launay)

Environnement et champignons : de l’émergence de la résistance à la prévention des risques (en partenariat avec la SFMM)

Étude prospective multicentrique (RADAR) de la résistance d’Aspergillus fumigatus aux azolés en France (Eric Dannaoui)
Emergence de la résistance environnementale d’Aspergillus (Patrice Lepape)
Prévention, contrôle et maitrise du risque d'aspergillose invasive au groupement hospitalier Edouard Herriot lors des travaux : apport de la surveillance et de l'alerte environnementale et épidémiologique (Sophie Loeffert)
Recommandations formalisées d’experts SF2H-SFMM : préventions en cas de travaux et Isolement protecteur des patients immunodéprimés (Jean-Pierre Gangneux)

Fungal interactions
Fungal endoparatism of nematodes (Jonathan Ewbank)
Effectors of fungal phytopathogens (Thierry Rouxel)

Fungal diversity
Genome evolution in cheese-associated fungi (Tatiana Giraud)
The 1002 yeast genome project (Gianni Liti)
Candida albicans genome dynamics during commensalism and chronic infections (Marie-Elisabeth Bougnoux)

Fungal cell biology
Botrytis cinerea secondary metabolism and pathogenesis (Murielle Viaud)
Polarity establishment in Candida albicans (Martine Bassilana)
Chlamydosporulation chez Candida albicans (Sophie Bachellier-Bassi)

Fungal biotechnology
Mining and exploiting plant polymer degrading enzymes in fungi (Marie-Noëlle Rosso)
Fatty acid metabolism in yeast (Jean-Marc Nicaud)
Biologie synthétique chez S. cerevisiae

Biodégradation des plastiques
Colonisation et biodégradation bactérienne des microplastiques en mer (Jean-François Ghiglione)
Biodégradation des polymères plastiques dans l’environnement : relations entre les propriétés de surface du matériau et le recrutement des consommateurs microbiens potentiels (Thierry Ferreira)
De nouveaux outils pour étudier la biodégradation de polymères oxobiodégradables (Boris Eyheraguibel)

Biotechnologie bactérienne
Bioconversion extractive pour la production d’acide 3 hydroxypropionique (Claire Saulou-Berion) 
Contrôle du métabolisme fermentaire par transfert d'électrons extracellulaires : électro-fermentation du glycérol (Roman Moscoviz)  

Stratégies préventives à la colonisation par des bactéries pathogènes et d’altération sur la chaîne alimentaire
Quelles stratégies de lutte pour garantir la sécurité sanitaire des aliments, de la fourche à la fourchette. Exemple des Campylobacters dans les filières avicoles (Marianne Chemaly)

Communautés microbiennes des aliments
Contamination des viandes de volailles : de la nécessité des approches de microbiologie classique et des métaomiques (Monique Zagorec)
Impact de la réduction du sel sur l'écosystème fromager et la flore d'altération (Sandra Helinck) 

Ecosystèmes microbiens dans les aliments
Distribution des colonies de bactéries dans une matrice fromagère : interactions avec l’environnement et conséquences sur l’affinage (Anne Thierry)
Activité et fonctionnalités des microorganismes dans un écosystème fromager (Sophie Landaud)

Stabilisation, préservation des microorganismes
Les bactéries lactiques sous la lumière du synchrotron pour comprendre les mécanismes de cryotolérance (Stéphanie Passot)
Prebiotics as protectans of lactic acid bacteria (Andrea Gomez-Zavaglia) 
Stabilisation d'un écosystème fromager simplifié par congélation et lyophilisation (Françoise Irlinger)

Du génotype au phénotype pour l’identification des agents du bioterrorisme
Construction d’une plateforme nationale d’identification et de typage des agents de la menace basée sur le développement des approches de séquençage NGS et de qPCR haut débit (Patrick Fach)
Striking against bioterrorism with advanced proteomics and reference methods (Jean Armengaud)

Exigences des installations confinées biologiques
C'est quoi un laboratoire NSB2/NSB3 (Alexandre Perakis)
Quelles démarches pour la validation des laboratoires NSB3 (Philippe Hoest)

De la norme à l'utilisation en sécurité biologique
Certification ou qualification? (Jacques Simons)
Les équipements de protection individuel au laboratoire et sur le terrain (Christine David)

Maitrise des risques et dualité en S2B 
Quelles approches méthodologiques ? (Yamina Kabane)
Retour d'expérience en dualité du programme « PRÉDÉMIC » (Sylvie Van der Werf)
Présentation du Comité Nationale Consultatif pour la Biosécurité (Patrice Binder) 


Histoire de la Microbiologie

Histoire de la SFM (Henri Monteil)
Légendes et réalités du "virus de Danysz" (Patrice Laudat)
Regarding claims that penicillin was discovered before 1928 (Gilbert Shama)